Реставрация зданий Московского Кремля в 1990-е гг. В 1993 г. по указу президента Б. Н. Ельцина начались реконструкционные работы в зданиях Московского Кремля, претерпевших значительные переделки в советское время. В 1993 г. снесено здание столовой, пристроенное к Грановитой палате в 1934 г., и на его месте к июню 1994 г. восстановлено Красное крыльцо (архитектор Н. Г. Мухин, 13-я мастерская «Моспроекта-2»).

По предложению П. П. Бородина, управляющего делами Президента Российской Федерации, художественное руководство интерьерными работами было поручено И. С. Глазунову, по рисункам которого (с участием И. И. Глазунова) в 1992–1994 гг. поэтапно созданы новые интерьеры приёмной и кабинета Б. Н. Ельцина, новое оформление зала заседаний Совета Безопасности РФ в 14-м корпусе (1932–1934, архитектор И. И. Рерберг; корпус снесён в 2016).

В 1994–1996 гг. реконструированы интерьеры здания Сената архитектора М. Ф. Казакова.

Боровицкая башня и Большой Кремлёвский дворец. Боровицкая башня и Большой Кремлёвский дворец.

Кинокомпания «Православная энциклопедия»Кинокомпания «Православная энциклопедия»

В 1997–1999 гг. проводились работы в Большом Кремлёвском дворце, отстроенном в 1839–1849 гг. в русско-византийском стиле (по проекту архитектора К. А. Тона, с участием В. А. Бакарева, Н. И. Чичагова, Ф. Ф. Рихтера, П. А. Герасимова, Н. А. Шохина, Н. Л. Бенуа и др.): на выходящем к Москва-реке фасаде сбит лепной герб СССР и восстановлены пять барельефов в виде двуглавых орлов в декоративных килевидных закомарах, а также гербы Москвы, Санкт-Петербурга, Казани, Астрахани, Польши и Тавриды. Отреставрированы часы и люкарны купола, флагшток. Разобрана пристройка 1925 г. над западной террасой дворца. Частично реконструированы интерьеры императорских покоев на первом этаже (кабинеты императора и императрицы, гостиная, опочивальня, будуар и др.).

На втором этаже по проекту Центральных научно-реставрационных проектных мастерских (1995–1996, архитектор С. В. Демидов) с участием фирмы «Реставратор М» (архитектор Е. В. Степанова) и других организаций воссозданы тронный Андреевский и Александровский залы, превращённые в 1933–1934 гг. по проекту И. А. Иванова-Шица в единый зал заседаний Всесоюзных съездов Советов (со статуей В. И. Ленина, 1939, скульптор С. Д. Меркуров). Отреставрированы с восстановлением убранства Георгиевский, Владимирский, Екатерининский, Кавалергардский залы, аванзал (с картиной С. Н. Присекина «Кто с мечом к нам придёт, от меча и погибнет», 1983) и более 20 других помещений.

Создан интерьер Малахитового зала (художники И. И. Глазунов, И. В. Кузнецов, архитектор А. В. Ванеев, скульптор Н. Е. Васильев) с колоннами из материала, имитирующего уральский малахит, арматурой (в память побед великого князя Александра Невского и царя Петра I), 18 овальными портретами великих князей, царей и императоров, проводивших военные кампании (И. И. Глазунов), мебелью, люстрами и торшерами в духе 17–18 вв. (бронзолитейная мастерская Д. В. Буланова).

Заново оформлены интерьеры Гостевого корпуса (возведён в 1933–1934 на месте церкви Спаса на Бору) – Петровский зал с двумя изразцовыми печами в духе начала 18 в., парадным портретом молодого Петра I (написан И. И. Глазуновым по портрету работы Г. Неллера) и картиной «Битва при Гангуте» (В. А. Штейн, И. В. Кузнецов), Каминный, Красный и Зелёный залы в духе классицизма и другие помещения с картинами И. С. Глазунова, пейзажами (О. Ф. Штыхно и И. В. Лапин), портретами Николая I (Д. А. Слепушкин) и К. А. Тона (М. Ю. Шаньков), геральдическими медальонами, люстрами, бра (Д. В. Буланов), реставрированными часами.

За работу по реставрации зданий Московского Кремля в 1997 г. И. С. Глазунов удостоен Государственной премии РФ.