Гомоло́гия (греч. ὁμολογία – соответствие) в биологии, соответствие органов и структур у организмов, обусловленное общностью происхождения. Первоначальное подобие строения гомологичных образований может быть вторично завуалировано различиями, возникшими в ходе эволюции в связи с развитием разных приспособлений и приобретением новых функций. Например, слуховые косточки в среднем ухе млекопитающих (стремечко, наковальня и молоточек) гомологичны соответственно гиомандибулярной, квадратной и сочленовной костям висцерального черепа других позвоночных. Гомология как первичное сходство, основанное на родстве, противостоит аналогии – вторичному сходству, возникающему у разных (в том числе не родственных друг другу) видов при развитии сходных приспособлений. Дал определение гомологии и противопоставил её аналогии Р. Оуэн (1843). Эволюционный смысл явлений гомологии объяснён Ч. Дарвином (1859).
Доказательство гомологии органов у разных видов основывается на 4 важнейших критериях:
сходстве морфологического плана строения органов;
сходстве их положения в организме по отношению к другим органам;
сходстве их развития в онтогенезе;
эволюционной преемственности промежуточных форм вплоть до общего предкового состояния.
Немецкий зоолог и анатом К. Гегенбаур (1898) назвал гомологию органов у разных видов «частной гомологией», противопоставив её «общей гомологии», под которой понимается соответствие структур в одном организме, возникающих из сходных эмбриональных зачатков и занимающих сходное положение по отношению к оси или плоскости симметрии.
Выделяют 3 формы общей гомологии: гомодинамию, гомотипию и гомономию.
В 20 в. термин «гомология» стали использовать также для обозначения соответствия генов и процессов морфогенеза, ведущих к формированию гомологичных органов. Однако у отдалённо родственных видов организмов между гомологией генов и гомологией органов нет простого соответствия, так как развитие сложных структур организма контролируется многими генами, взаимодействующими в онтогенетических процессах, и изменения одних генов могут быть компенсированы воздействием других. Поэтому гомология генов и гомология органов являются самостоятельными категориями. Особую категорию представляет также гомология хромосом – соответствие хромосом, несущих одинаковые наборы гомологичных генов (хотя при этом гомологичные гены могут быть представлены разными аллелями).