Опера́тор информацио́нных систе́м маркиро́вки, лицо, являющееся оператором государственной информационной системы мониторинга за оборотом товаров, подлежащих обязательной маркировке средствами идентификации, и оператором федеральной государственной информационной системы мониторинга движения лекарственных препаратов для медицинского применения от производителя до конечного потребителя с использованием в отношении лекарственных препаратов для медицинского применения средств идентификации [абзац 21 ст. 1.1 Федерального закона от 22 мая 2003 № 54-ФЗ «О применении контрольно-кассовой техники при осуществлении расчётов в РФ» (Закон № 54-ФЗ)].

Оператор информационных систем маркировки обрабатывает информацию, переданную ему оператором фискальных данных от пользователя в соответствии с условиями договора, заключённого между оператором фискальных данных и пользователем. При этом оператору информационных систем маркировки не требуется разрешение на обработку фискальных данных. Обработка такой информации оператором информационных систем маркировки осуществляется в соответствии с Федеральными законами от 28 декабря 2009 г. № 381-ФЗ «Об основах государственного регулирования торговой деятельности в РФ» (Закон № 381-ФЗ), от 12 апреля 2010 г. № 61-ФЗ «Об обращении лекарственных средств» (пункты 14, 15 ст. 4.4 Закона № 54-ФЗ). Оператор информационной системы мониторинга обладает правом на доступ к информации, содержащейся в информационной системе мониторинга, с возможностью её обработки, в том числе её предоставления и распространения, обеспечения доступа к ней и оказания услуг с её использованием (ч. 10 ст. 20.1 Закона № 381-ФЗ).

Оператором государственной информационной системы мониторинга за оборотом товаров, подлежащих обязательной маркировке средствами идентификации, является общество с ограниченной ответственностью «Оператор-ЦРПТ» (Центр развития перспективных технологий) [ч. 3 ст. 20.1 Федерального закона от 28 декабря 2009 № 381-ФЗ «Об основах государственного регулирования торговой деятельности в РФ» (Закон № 381-ФЗ), распоряжение Правительства РФ от 3 апреля 2019 № 620-р].