Микрогидродина́мика, изучает течения с характерным масштабом d = 10^–4– 10^–8 м. Типичными для микрогидродинамики являются процессы движения жидкостей или газов в узких щелях и тонких каналах (в том числе просачивание сквозь пористые среды), а также явления, связанные с обтеканием малых частиц, движением различных смесей и т. п.

Обычно подобные течения реализуются при малых числах Рейнольдса (${Re}$), когда инерцией жидкости можно пренебречь (приближение Стокса). Это существенно упрощает решение уравнений движения жидкости (уравнений Навье – Стокса). При малых масштабах ${d}$ существенную роль начинают играть эффекты поверхностного натяжения, диффузии, электризации, поляризации и намагничивания, передачи теплоты. С уменьшением величины ${Re}$ приближение Стокса остаётся справедливым до тех пор, пока можно не учитывать взаимодействие между молекулами жидкости или между другими более сложными структурными образованиями. В ряде случаев это ограничивает применение данного приближения величиной ${Re} > {10^{–5}}$. При меньших значениях ${Re}$, например в жидких кристаллах, начинают сказываться межмолекулярные взаимодействия, величина которых зависит от взаимной ориентации молекул. Процессы, имеющие масштаб ${d} = 10^{–8}–10^{–10}$ м, как правило, рассматриваются в рамках молекулярной и квантовой физики.

Микрогидродинамика находит применение при разработке элементов струйной техники и устройств струйной печати, при описании движения микроорганизмов и больших молекул, а также в различных отраслях химической, пищевой и фармацевтической промышленности.