Биофи́льтр (биологический фильтр), сооружение для биологической очистки сточных вод. Представляет собой круглый или прямоугольный в плане резервуар, заполненный фильтрующим материалом. Резервуар биофильтра имеет двойное дно: верхнее – с отверстиями (дренажное), нижнее – непроницаемое. Расстояние между днищами составляет не менее 0,6 м. В качестве фильтрующего материала применяют щебень, гравий, шлак, керамзит и др. с крупностью фракций загрузки 20–80 мм (объёмная загрузка) или пластмассу, асбестоцементные листы, керамические и металлические изделия, тканевые материалы и др. в виде блоков, рулонов или засыпных элементов (плоскостная загрузка). Объёмная загрузка имеет пористость 40–50 %, высота фильтрующего слоя составляет 1,5–4 м. В биофильтре с плоскостной загрузкой пористость в зависимости от материалов загрузки составляет 70–95 %, а высота фильтрующего слоя 4–12 м. Биофильтр размещают в отапливаемых или неотапливаемых помещениях либо на открытом воздухе.

Сточная вода после первичных отстойников через водораспределительную систему поступает в биофильтр и фильтруется через загрузочный материал, на поверхности которого образуется биоплёнка. Микроорганизмы биоплёнки представляют собой сложный биоценоз, включающий бактерии, простейших, грибы, водоросли и многоклеточные организмы. Органические загрязнения сточных вод сорбируются на биоплёнке и одновременно служат источником питания, энергии и развития биоценоза микроорганизмов. Через дренажное днище обработанная сточная вода стекает в отводящий лоток и далее – во вторичный отстойник. Производительность биофильтра по изъятию органических загрязнений в зависимости от его конструкции составляет 200–2500 г/м³.