Панмикси́я (от пан... и греч. μῖξις – смешивание), свободное скрещивание разнополых особей любых генотипов в популяции перекрёстнооплодотворяющихся организмов. Термин «панмиксия» введён А. Вейсманом в 1885 г.

Полная панмиксия возможна лишь в идеальных популяциях, имеющих бесконечно большую численность, в которых отсутствуют отбор, давление мутаций, миграции. Результатом панмиксии является равновероятное комбинирование всех типов гамет, производимых родительскими особями, и равновесное распределение частот генотипов из поколения в поколение. В реально существующих популяциях всегда действуют факторы (ограничение численности популяции, отсутствие свободного скрещивания и др.), изменяющие в ряду поколений частоты генов и генотипов.