Онколи́ты (от греч. ὄγκος – ком, опухоль, нарост и λίθος – камень) (микрофитолиты), сферические, желваковые и сгустковые, обычно известковые, ископаемые образования, часто со слоисто-концентрической структурой, возникшие в результате жизнедеятельности прокариот, в основном цианобактерий. Размер от долей миллиметров до 10 см. Распространены в карбонатных осадочных породах. По природе и способу образования близки к строматолитам, но в отличие от последних не были прикреплены к субстрату. Классификация онколитов основана на морфологических и текстурно-структурных особенностях строения. Выделяются группы (формальные роды) и формы (формальные виды). Важны для стратиграфии докембрия.