Journal of Proteome Research (J Proteome Res), рецензируемый научный журнал. Издаётся в США на английском языке с периодичностью 1 раз в месяц Американским химическим обществом.

В Journal of Proteome Research публикуются результаты исследований в области протеомики, охватывающих различные аспекты анализа белков и их функций, а также труды по геномике, метаболомике, биоинформатике и по применению экспериментальных данных из этих областей в клинической и сельскохозяйственной практике.

Редакционная коллегия в первую очередь публикует статьи, освещающие мультидисциплинарный подход к биологическим наукам, с учётом эффекта синергии при использовании различных омиксных технологий, изучающих устройство генома и реализацию закодированной в нём информации.

Journal of Proteome Research издаётся с 2002 г. Изначально периодичность публикаций составляла 1 раз в 2 месяца, но с 2006 г. новые номера выходят ежемесячно.

Главный редактор – профессор Дж. Йейтс. Он обучался зоологии и химии в Университете штата Мэн, получил докторскую степень по химии и прошёл постдокторантуру в Виргинском университете и Калифорнийском технологическом институте. Является обладателем нескольких американских премий в области аналитической и биоаналитической химии, химии белков и протеомики. В 2013 г., по данным The Analytical Scientist, был признан самым влиятельным специалистом в области аналитической химии. Имеет опыт работы в крупных научных журналах (Analytical Chemistry, Journal of Biomolecular Techniques). В настоящее время работает в Научно-исследовательском институте Скриппс и считается мировым специалистом в области протеомики.

Журнал индексируется базами данных: CAS, EBSCOhost, British Library, PubMed, Web of Science и Scopus.

ISSN: 1535-3893 (печатная версия), 1535-3907 (онлайн).

Наукометрические показатели журнала: SCImago Journal & Country Rank. В 2021 г. Journal of Proteome Research вошёл в 1-й квартиль (Q1) по направлениям «Biochemistry» и «Chemistry (miscellaneous)» , его SJR составил 1,38, а индекс Хирша – 168.