Изоля́ция (от франц. isolation – отделение, разобщение) в биологии, исключение или ограничение свободного скрещивания между особями одного вида, ведущее к обособлению внутривидовых групп и новых видов. Ч. Дарвин на примере островных фаун и флор показал роль изоляции в возникновении и углублении различий между близкими формами живых организмов.

Географическая изоляция – обособление определённых популяций от других популяций того же вида каким-либо труднопреодолимым географическим барьером: морским проливом, рекой, горным хребтом, участком пустыни и т. п. Может возникнуть в результате изменения физико-географических условий в пределах ареала вида или при расселении групп особей за прежние его пределы, когда «популяции основателей» могут закрепиться в обособленных районах с благоприятными для них условиями среды. Географическая изоляция – один из важных факторов видообразования, т. к. она препятствует скрещиванию и тем самым обмену наследственной информацией между обособленными популяциями.

Репродуктивная (биологическая) изоляция – нескрещиваемость в природных условиях между обитающими вместе организмами. Выделяют несколько основных форм репродуктивной изоляции: этологическую (различия в поведении), экологическую (разные предпочитаемые местообитания), сезонную, или временнýю (различные сроки размножения), морфологическую (различия в размерах, пропорциях и структурах организмов и отдельных органов) и генетическую (различия наследственного аппарата, приводящие к несовместимости половых клеток).

Все эти формы изоляции возникают независимо друг от друга и могут сочетаться в любых комбинациях. Наиболее эффективной из них является генетическая изоляция. Репродуктивная изоляция обусловливает возникновение независимости генофондов двух популяций, которые после этого могут стать самостоятельными видами. Возникновению репродуктивной изоляции часто способствует длительная географическая изоляция.