Двуме́рный электрофоре́з (2-DE, 2D-электрофорез), метод анализа состава крупных белковых комплексов и сложных белковых смесей, состоящих более чем из 100 белков, путём разделения на отдельные белки. Разделение белков происходит по двум различным физико-химическим свойствам, для чего проводят электрофорез в двух перпендикулярных направлениях. В первом направлении – по изоэлектрической точке, во втором – по молекулярной массе с помощью гель-электрофореза. Обе процедуры выполняются в полиакриламидном геле. В результате получают электрофореграмму, на которой представлены скопления (пятна) однородных белков, по их размеру и плотности можно судить о концентрации этих белков в образце. Для повышения эффективности метода необходимо на втором этапе процедуры изменить один из электрофоретических параметров, например концентрацию геля или pH буферного раствора.