Штамм (нем. Stamm, буквально – ствол, основа; семья, племя), чистая культура микроорганизма, выделенного из определённого источника или полученного в результате мутаций. Разные штаммы одного и того же микроорганизма могут различаться по ряду свойств (чувствительность к антибиотикам, вирулентность, способность синтезировать те или иные биологически активные соединения и т. д.). Штаммы микроорганизмов, применяемые в промышленности для микробиологического синтеза белков (в том числе ферментов), антибиотиков, витаминов, органических кислот и других веществ, значительно продуктивнее диких, т. к. при их создании проводится длительный и строгий отбор клеток с нужными свойствами.