Бассе́йн вну́тренних во́дных путе́й, часть внутренних водных путей, обособленная и имеющая общие климатические, навигационно-гидрографические условия обеспечения плавания судов и гидрометеорологические условия [абзац 21 ст. 3 Кодекс внутреннего водного транспорта РФ (КВВТ РФ)].

Границы бассейнов внутренних водных путей определены приказом Минтранса России от 17 августа 2012 г. № 316 «Об определении бассейнов внутренних водных путей Российской Федерации». В Приложении приказа определено 15 бассейнов внутренних водных путей: Беломорско-Онежский, Волго-Балтийский, Московский, Байкало-Ангарский, Енисейский, Обский, Обь-Иртышский, Печорский, Северодвинский, Азово-Донской, Волго-Донской, Камский, Волжский, Ленский, Амурский.

Правила движения и стоянки судов в бассейнах внутренних водных путей утверждены приказами Минтранса России. Например, приказом от 5 апреля 2017 г. № 137 утверждены Правила движения и стоянки судов в Волго-Балтийском бассейне внутренних водных путей РФ.

Содержание внутренних водных путей, государственный портовый контроль и иные функции в бассейне внутренних водных путей, согласно КВВТ РФ, осуществляет соответствующая администрация бассейна внутренних водных путей.

Одним из крупнейших в России является Обь-Иртышский бассейн внутренних водных путей, в состав которого входят 14 627 км эксплуатируемых внутренних водных путей, из которых протяжённость водных путей с гарантированными габаритами судовых ходов составляет 6192 км. Официальный сайт администрации Обь-Иртышского бассейна внутренних водных путей.