Протонефри́дии (от прото... и нефридии), органы выделения и осморегуляции у большинства плоских и первичнополостных червей (кроме нематод и волосатиков), у немертин, приапулид, некоторых кольчатых червей, у ланцетника, а также у личинок (в т. ч. актинотрох, трохофор). Состоят из одного или нескольких ветвящихся канальцев, залегающих в паренхиме или в полости тела животного. Канальцы со стороны полости тела замкнуты концевой клеткой с пучком ресничек («пламенная» клетка) или с одним или несколькими жгутиками (соленоцит), расположенными в просвете канальца. Через специальные клетки – циртоциты – осуществляется фильтрация на замкнутом конце. Биение ресничек или жгутиков способствует постоянному току жидкости в канальце протонефридий, в котором образуется моча. Канальцы впадают в главный канал, который обычно открывается 1–2 или несколькими порами во внешнюю среду. У сосальщиков, коловраток и некоторых других животных протонефридии открываются в мочевой пузырь, обладающий сократительными стенками, у скребней и приапудид – в половые протоки.