Ферментёр (франц. fermenteur), аппарат, в котором происходит преобразование исходного сырья в продукт с использованием биохимической деятельности микроорганизмов или изолированных клеток (микробиологический синтез) в условиях стерильности, перемешивания, продувания стерильным воздухом и постоянной температуры. Используется в биотехнологической, пищевой, фармацевтической и других отраслях промышленности. Представляет собой цилиндрический аппарат с нагревательным устройством, снабжённый барботёром для подачи стерильного воздуха и мешалкой.