Анеуплоиди́я (от а..., греч. εὖ – хорошо, форманта -πλόος – кратный и ...ид), явление, при котором клетки организма содержат число хромосом, некратное гаплоидному (одинарному) набору.

Среди анеуплоидов различают гиперформы – организмы с набором хромосом, увеличенным на одну хромосому или более, и гипоформы – с уменьшенным на одну или более хромосом в наборе. В свою очередь, они делятся на трисомики (с числом хромосом 2n+1), тетрасомики (2n+2), двойные трисомики (2n+1+1), моносомики (2n-1) и нуллисомики (2n-2).

Анеуплоидия лежит в основе ряда хромосомных болезней человека, например болезни Дауна, обусловленной наличием 21-й хромосомы в тройном количестве.

Анеуплоидию используют в генетике и селекции растений для определения локализации генов в хромосомах и перемещения или замещения хромосом и генов. Таким путём, например, в геном табака Nicotiana tabacum была введена пара хромосом другого вида, N. glutinosa, придавшая табаку устойчивость к вирусу табачной мозаики.